吳新雄此番履新后，首先將著手處理的是國家能源局重新組建后的機構改革事宜。
　　按照現行的機構設置，電監會與能源局有重疊。能源局與電監會同時設有政策法規司（部），能源局電力司也承擔電力體制改革有關工作。在這種機構設置下，吳新雄接下來要做的是厘清新能源局機構設置和分工。
　　新的能源局成立后，原電監會人員的分流去向是另一問題。目前，國家能源局機關行政編制為112名，正副司長職數30名；電監會機關事業編制為98名，局級領導職數28名。
　　而從中長期看，電監會以改革作為主要任務，新能源局主席由吳新雄擔任，使外界對于推進電力體制改革充滿期待。電力體制改革行進十年，這輛列車已然晚點。
　　在今年兩會期間，諸多來自電力系統的政協委員呼吁重啟電力體制改革，并提出改革路線。電監會副主席王禹民認為，應改變電網統購統銷的運行體制，以出臺獨立輸配電價為切入點，統籌推進輸配電體制改革，同時加快理順電價形成機制。
　　中電國際董事長李小琳提出，逐步放開用戶選擇權和議價權，實現電能買賣從管制壟斷型向競爭服務型轉變。同步放開110kV及以上專變用戶，同時確定開放其他用戶的時間表。
　　電力體制改革十年至今，仍然有諸多不同的意見。如何重啟電改，這是新任能源局局長吳新雄的第一要務。“其在電監會主席任上時，在深化輸配電改革論證上做了較多工作。”接近電監會的官員說。
　　但是，擺在吳面前的不僅僅是電力體制改革，而是涵蓋煤電油氣、新能源領域的體制改革。
　　目前，我國能源產業行政壟斷、市場壟斷和無序競爭現象并存，價格機制不完善；煤電矛盾日益突出；風電、太陽能發電、小水電和分布式發電上網受到電力系統及運行機制制約；能源行業管理薄弱，缺位與錯位現象并存，資源管理亟待規范，行業統計亟待加強。
　　相比電力體制改革而言，吳新雄面對的擔子和任務更加沉重。根據本報記者了解，此前國家能源局正在修改制定一份名為《深化能源體制改革的指導意見》的文件，該文件將確定能源體制改革的路線圖、時間表。
　　按照體制改革工作安排，“十二五”期間，我國有望在推進煤炭資源稅改革，電力市場建設，非常規能源多元化開發，多種氣源（煤層氣、煤制氣、頁巖氣等）公平接入天然氣管網，完善適應分布式能源和新能源發展的電力運行和管理體系、建立無歧視無障礙上網新機制等方面取得實質性突破。
　　隨著能源生產和消費規模的增加，吳新雄執掌下的能源局需要在體制上進行大刀闊斧再造。
　　在監管層面，電監會與能源局重組后，將采用“政監合一”的管理模式，并將擴大監管范圍。有電力監管系統的人士認為，應該強調政監并重，強化能源行業監管地位，在能源局內部保持相對獨立。
　　“監管效果關鍵在于賦予能源局的職能。監管如果沒有行政這條腿支撐，監管部門不會受到重視。目前電監會只有頒發許可證、安全監管，執行效果有限。電網、電廠核準建成后，不可能不允許發電并網。”上述人士說。